Szkoła Główna Mikołaja Kopernika łączy w swojej działalności akademickiej i naukowej pięć obszarów „kopernikańskich”, prowadząc Szkołę Doktorską w ramach: Kolegium Astronomii i Nauk Przyrodniczych w Toruniu, Kolegium Nauk Medycznych w Olsztynie, Kolegium Nauk Prawnych w Lublinie, Kolegium Filozofii i Teologii w Krakowie i Kolegium Nauk Ekonomicznych i Zarządzania w Warszawie. 

SGMK posiada uprawnienia do nadawania stopni naukowych doktora oraz doktora habilitowanego w dyscyplinach: ekonomia i finanse, nauki prawne, filozofia, nauki teologiczne, astronomia oraz nauki medyczne.

Program nauczania jest tworzony i wdrażany przez światowej klasy naukowców i ekspertów. SGMK zapewnia studentom bezpośredni dostęp do wiedzy naukowców i specjalistów z najlepszych ośrodków naukowych (m. in. M.I.T., Oxford University, Cambridge University, Stanford University, Princeton University, Harvard University, La Sapienzia i wiele innych), w tym szerokiego grona laureatów Nagrody Nobla: prof. Paul Krugman (w dziedzinie ekonomii), prof. William E. Moerner (w dziedzinie chemii), prof. Joachim Frank (w dziedzinie chemii), prof. Didier Queloz (w dziedzinie fizyki), prof. Michel Mayor (w dziedzinie fizyki), prof. Arthur B. Mc Donald (w dziedzinie fizyki), prof. James E.B. Peebles (w dziedzinie fizyki), prof. Barry Barish (w dziedzinie fizyki).

Nowoczesny program kształcenia zapewni studentom przygotowanie do efektywnego funkcjonowania w dynamicznie zmieniającej się rzeczywistości. Zapraszamy wszystkich zainteresowanych uzyskaniem stopnia naukowego doktora.